重庆大学生物工程学院于1998年正式建院，其前身是1979年设立的国内第一个生物力学研究室和生物医电教研室。学院下设生物医学工程系、生物工程系、重庆市医疗电子工程技术研究中心、基因工程研究中心、应用生物技术研究中心等二级单位。作为国家级人才培养和科学研究的重要基地，学院设备先进、学科齐全、师资力量雄厚。在国家“211工程”、“985工程”以及2006年首批进入的国家“111计划”（又称“高等学校学科创新引智基地”计划，该项目是由教育部与国家外国专家局设立的旨在通过引进或利用世界排名前100位的大学及研究机构中的有成就的学者，迅速提升学科的国际竞争力）等的强力支持和重点建设下，学院已建成现代化的生物力学实验室、基因工程实验室、细胞培养室、组织工程材料室、生化及分子生物学实验室、血液流变学实验室、医学电子实验室、医学图像室、植物细胞力学及植物组织工程实验室等。现拥有生物医学工程国家重点一级学科、1个博士后流动站，1个一级学科博士学位授权点，5个二级学科博士学位授权点，3个一级学科硕士学位授权点（覆盖23个二级学科硕士学位授权点），1个二级学科硕士学位授权点。学院拥有正副教授49人，博士生导师23人，硕士生导师50人，兼职院士1人、长江学者1人、海外名师1人、“百千万工程”国家人选1人、“教育部新世纪人才支持计划”3人、重庆市“322重点人才工程”一、二层次人选3人、重庆市学科评议组成员5人。中青年教师中拥有博士学位者近80%，并且相当一批具有在国外知名大学留学的经历。学院外籍教师Gurinder K Singh博士被重庆市政府授予2008年“重庆市优秀外籍教师奖”。有生物工程、生物医学工程两个本科专业，目前在校本科生545人，在校研究生640人，博士后进站3人。

　　2008年，获科研经费1200万元，其中国家高技术发展研究计划“863”项目 2项，国家自然科学基金 10 项，重庆市科技计划项目9项；在国内外学术刊物上发表论文156篇，其中SCI、EI收录论文 74 篇；申请发明专利41项，获权16项；获教育部高等学校技术发明二等奖一项，重庆市科学技术三等奖三项。学院有着广泛的国际学术交流背景，长期与美、英、日、法、德、加等国的许多著名大学和研究机构保持着密切的交流和合作，成功主办了“第十二届国际生物流变学大会暨第五届国际临床血液流变学大会”。随着“111计划”基地的建设，一大批国际大师级的专家将来我院讲学和开展合作研究。学院正在努力实现国内一流、国际知名的研究型学院的办学目标。