中国医学科学院输血研究所创建于1957年，其前身是中国人民解放军第十三军医学校（后改变为中国人民解放军259医院），1958年划归卫生部管理，更名中国医学科学院输血及血液学研究所，1965年从其前身是中国医学科学院输血及血液学研究所拆分出来，并由天津迁到四川成都，是我国唯一的国家级输血医学研究机构，从事输血医学科学研究、输血相关技术研究，为国家培养输血专业人才，为国家输血安全管理、应急医疗体系、输血科学技术发展及全民知识普及等方面提供信息咨询、理论依据和技术支持。出版《中国输血杂志》、《国际输血及血液学杂志》等刊物。设输血安全研究、血液免疫研究、生物技术研发和生物材料研发四大研究中心，涉及生物化学及分子生物学、病原生物学、免疫学、遗传学、细胞生物学、生物医学工程等多学科。重点研究方向包括：国家输血安全评价体系建立的基础研究，输血相关疾病的流行病学研究、输血传播病原微生物的检测及其评价，血液制品病毒灭活，HLA与造血干细胞移植相关研究，细胞治疗特别是脐血干细胞的基础与应用研究，红细胞血型研究特别是稀有血型的筛查和稀有血型库的建设，卫生部HLA参比实验室建设，细胞工程产品，基因工程药物，人血浆蛋白制品，红细胞血型血清诊断产品，血栓与止血体外诊断试剂，输血相关疾病快速诊断试剂、输血输液器材等。获国家、省部级科研成果65项，国家专利20余项。

　　输血所现有在职职工164人，其中，中高级科研人员87人，博士生导师2人，硕士研究生导师6人。现有卫生部批准的输血系统唯一的艾滋病确认实验室、HLA参比实验室，中国红十字总会批准的中国干细胞捐献者资料库组织配型实验室等重点实验室。