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主要参考书目：
1、普通化学：《普通化学(第四版)》，浙江大学普通化学教研室编，高等教育出版社。
2、地理信息系统：《地理信息系统概论》（修订版）黄杏元等主编，高等教育出版社。
3、自然地理学：《自然地理学》，潘树荣等编，高等教育出版社；《中国自然地理》，中国自然地理编写组编，高等教育出版社。
4、遥感概论:《遥感导论》，梅安新等，高等教育出版社；《遥感地学分析》，陈述彭，赵英时，测绘出版社。
5、普通生态学：《普通生态学（第二版）》，尚玉昌编著，北京大学出版社；《农业生态学》，骆世明主编，中国农业出版社。
6、植物生理学：《植物生理学》，潘瑞炽编，高等教育出版社。
7、生物化学（第四单元）：《生物化学》，沈同等编，高等教育出版社；《基础生物化学》，郭霭光主编，高等教育出版社。
8、环境化学：《环境化学》，戴树桂编，高等教育出版社；《环境化学》，王晓蓉编，南京大学出版社。
9、物理化学：《物理化学》，傅献彩等编，高等教育出版社。
10、土壤学：《土壤学》，黄昌勇主编，中国农业出版社；《中国土壤》李庆逵等编，科学出版社；《土壤地理学》张凤荣编，中国农业出版社。
11、微生物学：《微生物学教程》，周德庆著，高等教育出版社；《生物化学》，沈同等编，高等教育出版社。
12、植物营养学：《植物营养学》（上、下册）陆景陵、胡霭堂主编，中国农业出版社；《土壤－植物营养学——原理和施肥》,鲁如坤等,化学工业出版社。
13、水土保持学：《土壤侵蚀》，刘秉正、吴发启编著，陕西人民出版社；《水土保持学》，王礼先主编，中国林业出版社。
14、分析化学：《分析化学》（第四版），武汉大学主编，高等教育出版社。
15、普通地质学：《普通地质学》（第2版）,夏邦栋主编，地质出版社。
16、水文学基础：《水文地质学基础》王大纯、张人权等著，地质出版社；《水文学原理》芮孝芳编著，中国水利水电出版社，2004年版。
17、环境工程学：《环境工程学》（2005年版），蒋展鹏，高等教育出版社。
18、土壤肥料学：《土壤肥料学》，陆欣主编，中国农业大学出版社；《土壤肥料学通论》，沈其荣主编，高等教育出版社。
19、农业生态学：《农业生态学》，骆世明主编，中国农业出版社。
20、普通生物学、生物化学（生物工程）：请参考中国科学院研究生院公布的考试大纲。
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中国科学院南京土壤研究所2012年硕士研究生招生参考书目